Zginął w katastrofie polskiego samolotu Tu-154M w Smoleńsku 10 kwietnia 2010 w drodze na obchody 70. rocznicy zbrodni katyńskiej. Jego pogrzeb odbył się 26 kwietnia tego samego roku w Kwaterze Smoleńskiej na Cmentarzu Wojskowym na Powązkach w Warszawie. Jak się jednak okazało w wyniku ekshumacji, przeprowadzonej 6 grudnia 2016 w związku z prowadzonym w Prokuraturze Krajowej śledztwem w sprawie katastrofy smoleńskiej, jego ciało spoczywało w grobie Piotra Nurowskiego. Grób Mariusza Handzlika otwarto 28 grudnia tego samego roku i wydobyto z niego ciało Piotra Nurowskiego.
Życie prywatne Syn Tadeusza i Marianny. Miał troje dzieci: Julię, Iwonę i Jana.
Odznaczenia i wyróżnienia Krzyż Komandorski Orderu Odrodzenia Polski – 2010, pośmiertniePostanowienie Prezydenta Rzeczypospolitej Polskiej z dnia 16 kwietnia 2010 r. o nadaniu orderów (). Secretary of Defense Medal for Outstanding Public Service – 2000, Stany Zjednoczone Wielki Oficer Orderu Zasługi – 2008, Portugalia Wielki Oficer Orderu Wiernej Służby – 2009, Rumunia Honorary Officer Narodowego Orderu Zasługi – 2009, Malta Krzyż Komandorski Orderu Zasługi – 2009, Węgry Krzyż Komandorski Orderu „Za Zasługi dla Litwy” – 2009, Litwa Nagroda im.