We wrześniu 2003 roku przekształcono Komitet Kraju w samodzielne Biuro Oddziału. W tym samym roku liczba głosicieli w kraju przekroczyła 3000, a trzy lata później 4000. 20 stycznia 2007 roku oddano do użytku nowe Biuro Oddziału na południowych przedmieściach stolicy. W uroczystości wzięło udział 665 osób, w tym 170 delegatów z około 20 oddziałów. Z tej okazji okolicznościowe przemówienie wygłosił Anthony Morris, wówczas członek Ciała Kierowniczego.
Pod koniec 2009 roku do kraju dotarli misjonarze ze 127. klasy Szkoły Gilead. W tym też roku w Ugandzie usługiwało 40 misjonarzy Świadków Jehowy. W kraju działało wówczas 111 zborów i około 50 grup podzielonych na osiem obwodów, z których trzy to obwody lugandojęzyczne. Od 1994 do 2009 roku ponad 50 ugandyjskich głosicieli ukończyło Kurs Usługiwania organizowany w kenijskim Biurze Oddziału.
W 2009 roku w Komitecie Oddziału usługiwali: Mats Holmkvist, Martin Lowum, Michael Reiss i Fred Nyende.