Lata od 2005 Od sezonu 2004/2005 rozpoczęła się stopniowa odbudowa Vęgorii. W tym sezonie klub wywalczył awans z A klasy do klasy okręgowej, a w sezonie 2007/2008 grał już w IV lidze (po wygranych barażach z Romintą Gołdap - 3:0 i 1:1). Po reformie rozgrywek po sezonie 2007/08 zespół znalazł się w nowej III lidze podlasko-warmińsko-mazurskiej (IV poziom ligowy), w której grał przez 3 sezony (2008/09-2010/11). W tym ostatnim sezonie zajął 13. pozycję, która dawała utrzymanie, ale zarówno zwycięzca ligi (Olimpia Zambrów), jak i zdobywca 2. miejsca (Huragan Morąg) zrezygnowali z awansu i Vęgoria spadła do IV ligi warmińsko-mazurskiej, w której grała przez 3 sezony. W sezonie 2013/14 zajęła tam 14. miejsce i spadła do klasy okręgowej, gdzie gra do dzisiaj.
Sezon po sezonievegoria-wegorzewo.futbolowo.pl + Sezon Liga Pozycja Punkty Bramki Uwagi do 1945 ligi rejonowe Prus Wschodnich 1946-48 brak rozgrywek 1948/49 węgorzewskie drużyny nie przystąpiły do rozgrywek 1949/50 Klasa C (grupa Kętrzyn) 2(Ogniwo), 4(Gwardia) ? ?:? 1950/51 Klasa C(grupa Kętrzyn) 1 (Ogniwo), 4(Gwardia) 7 (Gwardia) ?:? Ogniwo awansowało do baraży o klasę B brak awansu (4 miejsce w barażach) 1952 IV klasa mistrzowska – – -:- reforma PZPN na jeden sezon tylko mecze towarzyskie 1953 klasa C(Kętrzyn) 5(Ogniwo), 2(Gwardia) ?:?