Pierwszy statek zawinął jeszcze przed oficjalnym otwarciem terminala, 1 czerwca 2007.
DCT Gdańsk w czerwcu 2011 roku osiągnęło swój pierwszy milionowy przeładunek. Milionowy kontener wpłynął do Gdańska na statku MS „Emma Maersk”.
W czerwcu 2011 roku wprowadzono nowy system operacyjny Navis SPARCS N4. W lipcu 2011 roku wdrożono E-SMART – narzędzia do wizualnego zarządzania sprzętem wyprodukowane przez brytyjską firmę International Terminal Solutions Ltd (ITS).
W roku 2014 deklarowane zdolności przeładunkowe terminalu kontenerowego sięgnęły 1,5 miliona TEU.
W styczniu 2015 roku rozpoczęto prace nad budową drugiego terminala T2, szacowanego na ok. 250 mln euro. W październiku 2016 DCT Gdańsk oddał do użytku nabrzeże T2 zlokalizowane pomiędzy terminalem T1 a pirsem rudowym wraz z 5 suwnicami STS, co pozwoliło na dwukrotne zwiększenie możliwości przeładunkowych: z 1,5 mln do 3 mln TEU (20-stopowych kontenerów), dzięki czemu DCT Gdańsk stał się największym pojedynczym terminalem Bałtyku. Jesienią 2018 rozpoczęto kolejną inwestycję w założeniu trwającą 3 lata o nazwie Program T2B, mającego w celu instalację trzech suwnic STS, automatyzacją bram i modernizacją kolei.