EcoRI rozpoznaje następującą sekwencją DNA:
5' G|A A T T C 3' 3' C T T A A|G 5'
gdzie: 5' – koniec 5′ DNA, 3' – koniec 3′ DNA, | – miejsce cięcia przez aktywność nukleazy. Produktem reakcji enzymatycznej katalizowanej przez EcoRI są wystające końce 5′, tak zwane końce lepkie:
5' G 3' 3' C T T A A 5'
Aktywność EcoRI jest blokowana przez aktywność metylazy M.EcoRI, która specyficznie metyluje DNA w obszarze rozpoznawanym przez EcoRI:
5' G A A T T C 3' 3' C T T A A G 5'
gdzie # oznacza grupę metylową.
Zastosowania Rozpoznawanie przez restryktazy specyficznej sekwencji DNA, połączone ze specyficznym cięciem, spowodowało, że wraz z ligazami DNA, używa się ich w biologii molekularnej do manipulacji fragmentami DNA. Samych restryktaz używa się m.in. do tworzenia map restrykcyjnych cząsteczek DNA (na przykład map plazmidów).
Przypisy
Linki zewnętrzne REBASE – baza danych o enzymach restrykcyjnych
Kategoria:Hydrolazy