W styczniu 2008 roku metropolita Saint Louis, arcybiskup Raymond Leo Burke, rozpoczął formalny proces usunięcia ze stanu kapłańskiego księdza Marka Bożka. 5 lutego 2008 roku spotkał się z nim, aby podjąć ostatnią próbę pojednania. Nie osiągnął jednak zamierzonych celów. 18 lutego 2008 roku kuria archidiecezjalna rozpoczęła proces przeciwko ekskomunikowanemu Markowi Bożkowi. 31 maja 2008 roku Stolica Apostolska podtrzymała ekskomunikę, którą został obłożony w grudniu 2005 roku proboszcz parafii Świętego Stanisława Kostki w Saint Louis.
Prezbiter RKK 9 marca 2009 roku Kongregacja Nauki Wiary podjęła decyzję o sekularyzowaniu Marka Bożka i wykluczeniu go z duchowieństwa rzymskokatolickiego. Uznano również, że udzielane przez niego od 2005 roku w parafii św. Stanisława Kostki w St. Louis sakramenty: bierzmowania, pokuty i małżeństwa są nieważne i wymagają w Kościele rzymskokatolickim powtórzenia sub conditione. Pozostałe są natomiast sprawowane niegodziwie.
W związku z decyzją Kurii Rzymskiej Marek Bożek zdecydował się przystąpić do Reformowanego Kościoła Katolickiego.