Po wykonaniu tych prac Inspektorat Techniczny miał powiadomić o uszkodzeniach i prowadzonych pracach PRS, by klasyfikator dokonał doraźnej inspekcji i ocenił poprawność naprawy. W dniu 13 stycznia 1993 r. naprawy furty nie ukończono w całości przed wyjściem w ostatni rejs, przez co nie spełniała ona wymogów strugoszczelności.
Przebieg katastrofy Przygotowanie do rejsu, opóźnienie mały|Prom kolejowo-samoch. „Jan Heweliusz” pływał na linii Świnoujście – Ystad – Świnoujście. Na zdjęciu plan portu Świnoujście MF „Jan Heweliusz” pod dowództwem kapitana Andrzeja Ułasiewicza miał wyruszyć w rejs do Ystad 13 stycznia 1993 r. o godzinie 21.00. W dniu 13 stycznia 1993 rozpoczął się załadunek na prom, którym kierował starszy oficer Roger Janicki. Dziesięć wagonów kolejowych (3 z Rumunii, 2 z Węgier, 2 z dawnej Czechosłowacji, 2 z Austrii i jeden ze Szwecji) zostało wtoczonych na dwa środkowe tory pokładu - drugi i trzeci. Po ich załadowaniu w związku z tym, że na pokładzie było jeszcze wolne miejsce, kierowcy zaparkowali dwanaście najcięższych ciężarówek z naczepami. Ustawili je symetrycznie na obu burtach i pozostawili na hamulcach ręcznych i wrzuconych biegach.