Równolegle do działalności kościelnej i patriotycznej Piotr Kobyliński zajmował się pracą badawczą i publicystyczną. W 1865 prowadził poszukiwania grobu księcia kaliskiego Mieszka III Starego. Po powstaniu styczniowym rozpoczął regularną publikację artykułów na tematy historyczne i społeczne w „Tygodniku Katolickim Grodziskim”, w tygodniku „Kaliszanin” i późniejszym dzienniku „Gazeta Kaliska”, „Pamiętniku Religijno-Moralnym” oraz „Przeglądzie Katolickim”. Tematyką jego prac była historia Kaliskiego, kwestie społeczne, historia Kościoła i liturgii. Jego praca Kalisz pod względem religijnym z głównym poglądem na kolegiatę, uważana jest powszechnie za pierwszą monografię miasta Kalisza. Na łamach "Pamiętnika Religijno-Moralnego" przetłumaczył z łaciny na język polski wczesnochrześcijański List do Diogneta i opatrzył go komentarzem.
Ks. Piotr Kobyliński brał czynny udział w powstaniu styczniowym, podczas którego został wyznaczony na prezesa komitetu Straży Bezpieczeństwa na teren powiatu kaliskiego. Za udział w powstaniu został aresztowany przez Rosjan. W jego obronie chłopi z Dobrzeca całą parafią udali się do generała Bellegarde i zażądali zwolnienia swojego proboszcza. Władze carskie nie chcąc antagonizować włościan w trakcie powstania pod presją zwolniły ks. Kobylińskiego.