Fakty Portugalska żandarmeria w początkowej fazie śledztwa uznała, że dziewczynka została uprowadzona, jednakże wkrótce po zniknięciu Madeleine wydział kryminalny portugalskiej policji wysnuł hipotezę, że dziecko mogło umrzeć z niewiadomych przyczyn w swoim pokoju hotelowym.
Portugalska policja zawiesiła poszukiwania dziewczynki i umorzyła śledztwo.
Do lutego 2013 roku Scotland Yard zidentyfikował 195 niesprawdzonych scenariuszy oraz nowe tropy, które mogą pomóc w rozwiązaniu sprawy.
Hipotezy Według jednej z hipotez dziewczynka została uprowadzona przez siatkę pedofilów. W 2012 roku pedofil Raymond Hewlett wyznał przed śmiercią, że dziewczynka może znajdować się w Rosji lub Ukrainie.
Według innej Madeleine McCann zginęła w nieszczęśliwym wypadku, kiedy wraz z rodzicami przebywała w apartamencie w Algarve. Rodzice dziewczynki zatuszowali jej śmierć i upozorowali porwanie. Niektórzy zarzucali matce Madeleine, że sama brała udział w uprowadzeniu lub w ewentualnym ukryciu zwłok córki.