Decyzja spotkała się z potępieniem ze strony opinii międzynarodowej i części społeczeństwa.
W lipcu 2006 roku, po ośmiu latach negocjacji przedstawicieli Organizacji Narodów Zjednoczonych z rządem, rozpoczął działalność mieszany, krajowo-międzynarodowy trybunał dla osądzenia zbrodni popełnionych przez Czerwonych Khmerów. W wyniku ustaleń poczynionych przez jego członków niemal 30 lat po upadku reżimu, postawiono zarzuty pierwszemu z przywódców. Komendant więzienia w Tuol Sleng, znany jako towarzysz Duch, przyznał, że w jego katowni zamęczono niemal 20 tysięcy ludzi. W wywiadzie udzielonym w 1999 roku stwierdził, że pozostali przywódcy Czerwonych Khmerów doskonale wiedzieli o tym, co się dzieje w więzieniu. Na pierwszym miejscu wymienił Pol Pota, a zaraz po nim Nuona CheaWojciech Lorenz, Z Pol Potem mordował naród, „Rzeczpospolita” 20-09-2007.
19 września 2007 roku policjanci i agenci zachodnich służb specjalnych otoczyli drewniany dom w Pailĭn, przy granicy Kambodży z Tajlandią, gdzie 82-letni Nuon Chea mieszkał z żoną. Na pokładzie śmigłowca przetransportowano go do aresztu w stolicy kraju, Phnom Penh. Tam został oskarżony o zbrodnie wojenne i przeciwko ludzkości, Associated Press (International Herald Tribune), September 18, 2007..