Papież musiał z tego powodu odwołać ustalone na 8 września odczytanie bulli godzącej w Filipa Pięknego.
Kluczowa rola w procesie templariuszy Nogaret był jednym z inicjatorów procesu templariuszy i przyczynił się w dużym stopniu do skazania ich hierarchów na karę śmierci przez spalenie na stosie. Według niektórych źródeł osobiście przesłuchiwał Jakuba de Molay, wielkiego mistrza oraz innych zwierzchników zakonu, poddawszy ich uprzednio wymyślnym torturom, w rezultacie czego przyznali się oni do herezji. Sterowany przez Nogareta proces skutkował wydaniem wyroku śmierci na niemal wszystkich hierarchów zakonu.
Podczas egzekucji palony na stosie Jakub de Molay według legendy miał w ostatnich słowach wykrzyknąć: Avant un an, je vous cite à paraître au tribunal de Dieu ... [Rycerzu Wilhelmie, królu Filipie, papieżu Klemensie! Nim rok minie spotkamy się na Sądzie Bożym]. Papież i król zmarli faktycznie krótko po śmierci mistrza, jednakże Nogaret zmarł w rzeczywistości w 1313 roku.