Od 2001 był drugim trenerem PGE Skry Bełchatów. 9 stycznia 2009 podpisał 2-letni kontrakt. W latach 2009–2013 pełnił funkcję I trenera tego zespołu. Na stanowisku zastąpił dotychczasowego szkoleniowca Daniela Castellaniego – nowo wybranego trenera kadry narodowej – którego był asystentem. Jako I trener został mistrzem Polski w 2010 i 2011, wicemistrzem w 2012, zdobył medale Ligi Mistrzów: brązowy w 2010 i srebrny 2012, Puchar Polski 2010, 2011, 2012. Pod jego wodzą PGE zdobywała również medale Klubowych Mistrzostw Świata: srebrne w 2009 i 2010, brązowy w 2012. Po sezonie 2012/2013, w którym Skra zajęła 5. miejsce, następcą Nawrockiego został Miguel Falasca.
Na początku 2011 był pretendentem do objęcia stanowiska selekcjonera kadry polskich siatkarzy, które to pozostawało puste po tym jak 25 października 2010 roku został zwolniony Daniel Castellani. Jacek Nawrocki deklarował, iż obejmując reprezentację nie chciałby rezygnować z pracy w klubie. PZPS ostatecznie nie zgodził się na łączenie obu funkcji i nowym selekcjonerem reprezentacji został Andrea Anastasi.