Miłkowski wskazuje za Ernstem Mayrem, że w biologii podstawową koncepcją wyjaśniającą jest przystosowanie do środowiska. Takie założenie adaptacjonizmu podważyli Steven Jay Gould i Richard Lewontin w swoim niesłychanie głośnym tekście Katedra św. Marka a paradygmat Panglossa. przyrównując adaptacjonistów do doktora Panglossa, który w Wolterowskim Kandydzie zawsze potrafił znaleźć rację istnienia dowolnej rzeczy, co dowodziło, że świat jest najlepszy z możliwych. Weszli przez to w spór m.in. z Richardem Dawkinsem broniącym tezy, że rola rozumowania adaptacyjnego w wyjaśnieniu ewolucji jest najważniejsza. Sterelny, K. (2007). Dawkins Vs Gould: Survival of the Fittest. Cambridge, U.K.: Icon Books. Wchodził w polemikę z Dawkinsem również w przedmiocie poziomu doboru, twierdząc, że od genotypu ważniejszy jest fenotypS.J. Gould, Troskliwe grupy i samolubne geny, [w:] tenże, Niewczesny pogrzeb Darwina, przeł. Nina Kancewicz-Hoffman, wybrał oraz przedmową i przypisami opatrzył Antoni Hoffman, Prószyński i S-ka, W arszawa 1999, s. 165..