Istotnym czynnikiem w grze są dynastie i postacie do nich należące. Postacie w Mrocznych Wiekach posiadają cztery atrybuty (intrygi, zarządzanie, dyplomacja, wojsko), dwa wskaźniki (pobożność – wskaźnik religijności władcy i prestiż – wskaźnik jego postrzegania przez świat) oraz pewne cechy (np. ekskomunika – łatwiejsze odebranie tytułu, chutliwość – wyższa płodność kosztem spadku pobożności, okrucieństwo czy hojność) oraz trzy ukryte wartości (reputacja, zdrowie i płodność). Atrybuty pomagają graczowi w zarządzaniu, zabójstwach, wzroście wierności wasali itp. Są one dziedziczone przez potomków władców, zależą też od wydarzeń i cech. Swoje cechy władca może podnosić, mianując swoich dworzan na majordomusa (zarządzanie), kanclerza (dyplomacja), mistrza szpiegów (intrygi) oraz marszałka (umiejętności wojenne). Dynastie w grze mogą rozszerzać swoje wpływy na inne państwa poprzez małżeństwa.
W Mrocznych Wiekach, w przeciwieństwie do serii Europa Universalis, brakuje historycznych wydarzeń. Istnieją w niej natomiast wydarzenia losowe oraz wydarzenia wywołane przez działania gracza.