Francia politycznie i gospodarczo odizolował Paragwaj od innych państw Ameryki Południowej. Rządy sprawował twardą ręką – przedstawicieli opozycji mordował lub zamykał w więzieniu. Występował przeciw kreolskiej elicie społecznej i hierarchii kościelnej, zwiększył znaczenie indiańsko-metyskiego chłopstwa. Gospodarkę kraju oparł na rolnictwie, stwarzając model państwa samowystarczalnego ekonomicznie i kontrolującego większą część działalności gospodarczej. W polityce zagranicznej udało mu się zachować niepodległość Paragwaju, mimo konfliktów z większymi i silniejszymi sąsiadami (Argentyna, Brazylia).
Doznawszy zawodu miłosnego, stronił od kobiet i nie założył rodziny. Swoich krewnych również nie obdarzał zaufaniem: uwięził brata, dwóch szwagrów, a siostrzeńca kazał stracić.