Wewnątrz kabiny pasażerskiej dodano więcej drewnianych elementów wykończenia, wersja GS 300 otrzymała możliwość zmiany biegów poprzez przyciski na kole kierownicy. Samochód otrzymał powiększoną o 0,3 l jednostkę V8, co pociągnęło za sobą zmianę nazwy na GS 430 (UZS161). Moc maksymalna pozostała na tym samym co wcześniej poziomie, maksymalny moment obrotowy wzrósł jednak do 441 N·m.

W roku 2001 Lexus dodał do swojej oferty limitowaną wersję GS 300 "SportDesign". Zawierała ona układ zawieszenia przejęty z GS 430, szersze opony 225/55VR-16 Michelin Pilot HX oraz polerowane felgi ze stopów lekkich. Wewnątrz samochód otrzymał skórzane wykończenie z większa liczbą czarnych i stalowych akcentów. Produkcja limitowanej wersji utrzymywała się na poziomie 3300 egzemplarzy rocznie, zakończono ją w 2004 roku.

Trzecia generacja

mały|225px|lewo|Tył GS III mały|225px|lewo|Wnętrze