Planuje się także zastosowanie do roli jednostek napędowych APU silników Wankla, które są lżejsze niż silniki tłokowe i zużywają mniej paliwa niż turbiny.
Jednostki APU zainstalowane w cywilnych dwusilnikowych samolotach transportowych standardu ETOPS stanowią bardzo ważny element bezpieczeństwa systemu napędowego, zapewniając energię elektryczną i sprężone powietrze w przypadku awarii jednego z silników głównych, odciążając drugi z nich. APU tego typu muszą posiadać zdolność włączania się bez względu na pułap lotu. Współcześnie stosowane APU są zdolne włączać się do pułapu 14 300 metrów w warunkach całkowitego zawilgocenia lub oblodzenia.
Urządzenia APU stanowią również bardzo ważny system wahadłowców kosmicznych napędzając układy hydrauliczne, a nie elektryczne jak w samolotach. Trzy niezależne jednostki APU napędzane hydrazyną zapewniają energię do napędzania powierzchni sterowych wahadłowca oraz stabilizowania dysz silników podczas startu. Podczas lądowania zapewniają również zasilanie hamulców aerodynamicznych.