Ze względu na niezgodność źródeł próba odtworzenia przebiegu nauki u boku Ghirlandaia stanowi trudne zadanie. Zdaniem historyka sztuki Moniciego Girardiego, Michał Anioł mógł spędzić w warsztacie mniej niż dwa lata, gdzie uczył się wyłącznie techniki malowania fresku. Historyk sztuki Luba Ristujczina twierdzi natomiast, że miał uczyć się w warsztacie Ghirlandaia przez trzy lata. Biografista artysty w podaje, że ten w podeszłym wieku zaprzeczał, by uczył się w pracowni Ghirlandaia. Tej wersji trzymał się także Giorgio Vasari. Według anegdot, Michał Anioł miał w wolnym czasie kopiować dzieła innych malarzy i umyślnie je postarzać, by wyglądały na oryginały. Niemieccy historycy sztuki i stwierdzili, że ważnym etapem nauki Michała Anioła było odtwarzanie dzieł dawnych mistrzów. Większość szkiców z tamtego okresu artysta miał później zniszczyć.