W kolejnych stuleciach Faerûn doświadczał wojen z orkami, trollami oraz innymi potworami, a także wzrostu znaczenia ludzi, którzy stopniowo stali się dominującą siłą cywilizacyjną.
Waterdeep wyrosło na największe i najważniejsze miasto Faerûnu, zamieszkane przez wielorasową społeczność kupców, rzemieślników i wojowników. Miasto kilkukrotnie stawało w obliczu zagłady, m.in. podczas wojen z trollami. Kluczową rolę w jego obronie odegrał potężny mag Ahgairon z Silverymoon, który później został Pierwszym Lordem Waterdeep.
Kolejne wieki przyniosły zarówno okresy rozwoju, jak i konflikty wewnętrzne, zarazy oraz długotrwałe wojny, w tym czterdziestoletni konflikt z ożywieńcami oraz masową inwazję orków.
Czas Kłopotów Jednym z najważniejszych punktów zwrotnych w historii Faerûnu był Czas Kłopotów. W jego trakcie bogowie zeszli na Toril w cielesnych postaciach, co doprowadziło do chaosu na niespotykaną skalę. Bogowie Bane, Bhaal i Myrkul zostali zgładzeni, a ich domeny przejął Cyric. Bogini magii Mystra również zginęła, lecz odrodziła się jako śmiertelna kobieta imieniem Midnight.