Santa Cruz, z Puerto Ayorą, jest największym ośrodkiem usługowym i gospodarczym. To także najludniejszy kanton prowincji. Ruch lotniczy z Ekwadoru kontynentalnego obsługują lotniska na dwóch wyspach – Baltrze i San Cristóbal.
Izolacja od kontynentu sprawia, że prowincja jest zależna od transportu morskiego i lotniczego. Dostawy towarów, przemieszczanie mieszkańców i obsługa ruchu turystycznego wymagają stałej kontroli sanitarnej i środowiskowej, ponieważ przypadkowe wprowadzenie obcych gatunków należy do najpoważniejszych zagrożeń dla przyrody Galápagos.
Ochrona przyrody i zarządzanie ruchem
Ochrona przyrody jest podstawowym czynnikiem kształtującym politykę publiczną w prowincji. Zapoczątkował ją dekret wykonawczy nr 17 z 1959 roku, którym Ekwador uznał przyrodniczą wartość wysp i utworzył na nich park narodowy. Park Narodowy Galápagos obejmuje niemal całą lądową powierzchnię archipelagu poza strefami osadnictwa i użytkowania gospodarczego, natomiast Rezerwat Morski Galápagos chroni rozległe wody otaczające wyspy. Administracja parku podkreśla, że archipelag zachowuje 95% pierwotnie zarejestrowanej różnorodności biologicznej dzięki działaniom ochronnym państwa ekwadorskiego i organizacji współpracujących.