19 stycznia 2012 rozbił się CH-53D USMC, zabijając sześciu żołnierzy ISAF. W wypadku 21 czerwca 2012 utracono CH-53D, bez ofiar w ludziach. 14 stycznia 2016 roku dwa CH-53E zderzyły się w pobliżu Oʻahu, zginęło dwanaście osób (wszyscy obecni na pokładzie obu maszyn), jako przyczynę wskazano błąd pilota. 3 kwietnia 2018 roku w Kalifornii przy granicy z Meksykiem rozbił się CH-53E, zginęło czterech żołnierzy[>http://www.defence24.pl/usa-cztery-ofiary-smiertelnie-katastrofy-smiglowca-ch-53e USA: cztery ofiary śmiertelnie katastrofy śmigłowca CH-53E.].
Wersje Śmigłowiec S-65 występował w wielu wersjach przystosowanych do różnych zadań: YCH-53A – dwa prototypy CH-53A – początkowa produkcja dla USMC, 139 sztuk RH-53A – wersja do zwalczania min morskich, 15 CH-53A zmodernizowanych dla US Navy, zwrócone po dostarczeniu RH-53D TH-53A – CH-53A używane do treningu przez USAF CH-53C – wersja o zwiększonym udźwigu dla USAF, 22 sztuki S-65C-2 (S-65Öe) – wersja eksportowana do Austrii, 2 sztuki, potem sprzedane do Izraela S-65-C-3 – wersja eksportowana dla Izraela, 25 sztuk CH-53D – ulepszony CH-53A, 126 sztuk RH-53D – ulepszona przeciwminowa wersja, 30 sztuk dla US Navy, 6 dla Iranu, USMC używał 16 RH-53D do 2004 VH-53D – dwa CH-53D dla USMC przeznaczone do transportu VIP-ów CH-53E Super Stallion/S-80 – trójsilnikowa odmiana