Jedną ze znaczących różnic jest fakt, iż sztuczna inteligencja pozwala niektórym przeciwnikom na otwieranie zamkniętych drzwi, a także na korzystanie ze znalezionych apteczek, czy też zakładanie na siebie zbroi, jeśli na taką natrafią w trakcie poruszania się po danej planszy. Na niektórych poziomach specjalnych można dodatkowo napotkać bossów, których pierwowzory pochodzą z innych strzelanek niż Doom. Za pokonywanie przeciwników gracz nagradzany jest punktami doświadczenia, dzięki którym awansuje na kolejne poziomy doświadczenia. Na każdym z nich gracz zyskuje możliwość przyswojenia nowej umiejętności. Niektórzy pokonani przeciwnicy zostawiają po sobie używaną przez nich amunicję oraz broń.
Wśród przedmiotów znajdowanych w grze można wyróżnić broń, amunicję do niej, pancerze, buty, specjalne moduły służące do modyfikowania założonego ekwipunku i inne (np. apteczki). Gracz może znaleźć łącznie kilkadziesiąt rodzajów broni, w tym osiem występujących w dwóch pierwszych odsłonach gry Doom – od piły łańcuchowej do BFG9000. W przeciwieństwie do typowych gier gatunku roguelike, DoomRL kładzie nacisk na walkę dystansową. Broń występująca w grze zużywa jeden z czterech rodzajów amunicji: pistoletową/karabinową, do strzelb, do broni plazmowej lub rakiety.