Według pierwszego podziału wyróżnia się:
filozofię spekulatywną – za pomocą której poznajemy prawa przyrody filozofię operatywną – za pomocą której stosuje się prawa przyrody
Zgodnie z drugim podziałem filozofia przyrody dzieli się na:
fizykę – naukę o tym, jak rzeczy są zbudowane i jak powstają metafizykę – naukę o tym, jaka jest ich istota i cel
Filozofia człowieka antropologia – o jednostkach ludzkich. Obejmuje naukę o ciele i duszy człowieka. Z duszą wiązał Bacon logikę (naukę o myśli poznającej prawdę) i etykę (naukę o woli skierowanej ku dobru) polityka – o społeczeństwie
„Tyle mamy władzy, ile wiedzy” Bacon wyżej cenił wiedzę praktyczną niż czysto teoretyczną. Nauka miała przyczyniać się do poprawy życia człowieka poprzez dawanie mu nowych mocy i wynalazków. Dzięki poznaniu mechanizmów przyrody człowiek będzie mógł zapanować nad nią. Z tego powodu Bacon cenił ze wszystkich nauk najwyżej przyrodoznawstwo – było najbliższe temu celowi.
Był pod bardzo silnym wrażeniem trzech wynalazków: druku, kompasu i prochu strzelniczego. Uważał, że to one zrewolucjonizowały świat na lepsze.
Jego zdaniem nauka kontemplacyjna była nieskuteczna. Chodzi o to, by zbadać przyrodę, a nie rozmawiać o niej.