Od września 1939 do lutego 1940 uczestniczył w ewakuacji Kuratorium Okręgu Szkolnego Krakowskiego. Następnie udał się do rodziny spędzającej urlop w Kołomyi. W lutym 1940 wrócił do Zakopanego. 12 lutego 1940 został aresztowany przez gestapo. Został zwolniony po dwunastu dniach więzienia na podstawie zaświadczeń lekarskich o chorobie płuc, otrzymał nakaz opuszczenia Zakopanego i powiatu nowotarskiego w ciągu trzech dni. Zamieszkał we wsi Zawadka, a po roku w Tymbarku, gdzie pracował w Podhalańskiej Spółdzielni Owocarsko-Warzywniczej. W latach 1942–1945 był kierownikiem i nauczycielem tajnego nauczania w powiecie limanowskim. Działał w Armii Krajowej, kierując Powiatową Komisją Oświaty i Wychowania obwodu limanowskiego oraz współpracując z komórką informacji i propagandy inspektoratu AK Nowy Sącz. Zasięg tajnego nauczania z czasem rozszerzył się na cały powiat limanowski. Udało się przeprowadzić dwa egzaminy maturalne.