Dorobek naukowy Zainteresowania naukowe Zygmunta Wnuka obejmowały florystykę, fitosocjologię, fitogeografię, geobotanikę oraz ekologię roślin ze szczególnym uwzględnieniem fitocenoz segetalnych oraz ochrony przyrody i wpływu turystyki na ekosystemy obszarów chronionych. Dokumentacje projektowe, które powstały w wyniku prac naukowo-badawczych Zygmunta Wnuka pozwoliły na utworzenie rezerwatów przyrody: „Piskorzeniec”, „Murawy Dobromierskie”, „Czarna Rózga”, „Diabla Góra”, „Ewelinów”, „Góra Chełm”, „Szwajcaria Ropczycka”, „Stubno”, „Mójka” i „Wilcze”. Badania przyczyniły się do powstania parków krajobrazowych: Przedborskiego, Sulejowskiego, Spalskiego i Czarnorzecko-Strzyżowskiego. Łącznie był autorem lub współautorem 214 publikacjiPełne zestawienie prac Zygmunta Wnuka zob.: Bibliografia publikacji dr. hab. Zygmunta Wnuka (w:) Zygmunt Wnuk 1942-2016. Życie i praca Profesora Uniwersytetu Rzeszowskiego, naukowca, pedagoga i obrońcy przyrody, Rzeszów: Wydawnictwo Uniwersytetu Rzeszowskiego, 2018. S. 55-74.
Działalność społeczna W latach 1968–1990 należał do PZPR. Ponadto był członkiem licznych stowarzyszeń naukowych i społecznych m.