Wyjątkiem w pierwszej fazie było to, że kanadyjskie kluby rozegrają między sobą sześć meczów z powodu zakazu podróży do Stanów Zjednoczonych oraz że FC Dallas i Nashville SC rozegrają między sobą dodatkowe trzy mecze, aby zrekompensować fakt, że nie mogli zagrać w MLS is Back Tournament.
11 września liga ogłosiła „drugi etap” restartu z trzema kolejnymi meczami dla każdej drużyny. W tej fazie drużyny kanadyjskie i amerykańskie ponownie grały ze sobą, ale tylko we własnej bańce geograficznej. Ta faza obejmowała dwa mecze wyjazdowe i jeden (wyznaczony u siebie) mecz na neutralnym miejscu dla każdej z kanadyjskich drużyn organizującymi mecze odpowiednio w Portland, Harrison i Hartford.
17 października, po decyzji ISC (Niezależnej Rady Kibiców), ogłoszono, że Tarcza Kibiców nie zostanie przyznana najlepszej drużynie sezonu zasadniczego w 2020 roku. W oficjalnym komunikacie Fundacja Tarcza Kibiców stwierdziła: "Po wielu rozważaniach i dyskusjach Fundacja Tarcza Kibica postanowiła zrezygnować z przyznania Tarczy Kibica za sezon 2020. Nie jest to łatwa decyzja.