W oparciu o skrupulatną pracę powstał ostateczny raport przedstawiający metodologię stosowanych przez juntę represji.
Spośród szesnastu członków Komisji na jej przewodniczącego wybrano Ernesto Sábato. Komisja współpracowała również z członkami innych organizacji działających na rzecz praw człowieka, które stanowiły jedno ze źródeł informacji na temat zbrodni popełnionych w czasie tzw. brudnej wojny. Zwieńczeniem pracy CONADEP była publikacja Nigdy więcej w 1984 roku. Raport przedstawiał wyniki badań, zawierał także świadectwa ofiar oraz świadków represji. Raport stał się również jednym z ważniejszych dowodów wykorzystanych podczas procesów toczonych przeciwko członkom junty wojskowej. W trakcie pracy Komisji zarejestrowanych zostało 8960 przypadków tajemniczych zaginięć. Uważa się jednak, że na każdy zgłoszony przypadek zaginięcia przypadały jeszcze dwa, które nigdy nie zostały zarejestrowane, a za symboliczną liczbę przyjmuje się 30 000 osób.