Restylizacje W grudniu 2022 roku producent zapowiedział pierwszą restylizację modelu. Oficjalna premiera poliftingowego ID.3 odbyła się wiosną 2023. Dostał oprogramowanie najnowszej generacji, które podniesie wydajność systemu i może być aktualizowane zdalnie (over-the-air). Wewnątrz zwiększono przekątną ekranu dotykowego z 10 do 12 cali, a także wprowadzono podwójną podłogę bagażnika oraz konsolę środkową z dwoma uchwytami na napoje. Producent wprowadził nowe funkcje jak Plug&Charge oraz inteligentne planowanie trasy, uwzględniające stacje ładowania. ID.3 na zewnątrz zyskał lekko zmieniony pas przedni z wlotami powietrza w kształcie litery C, a także przeprojektowany zderzak i mniej powierzchni w kontrastowej, czarnej barwie.
W kwietniu 2026 roku samochód przeszedł drugą, znacznie rozleglejszą niż poprzednio modernizację, przy okazji której dokonano korekty nazwy na Volkswagen ID.3 Neo. Przeprojektowano pas przedni, który zyskał przemodelowany zderzak i wkłady reflektorów, a także charakterystyczną, rozbudowaną listwę świetlną pomiędzy nimi wzbogaconą także o świecące się logo. Ponadto, kosmetyczne zmiany przeszedł także zderzak tylny, a klapa bagażnika utraciła malowany na kontrastową czerń panel na klapie bagażnika i odtąd zyskał on barwę tożsamą z lakierem nadwozia.