Kontrolę nad miastem przejęły niezdyscyplinowane oddziały Kozaków syberyjskich, zastraszające miejscową ludnośćJ. D. Smele, Civil war…, s. 81.. W mieście Iwanow-Rinow utworzył Korpus Stepowy, którego został dowódcą i na czele którego zdobył dla białych znaczną część stepów syberyjskich. 16 lipca 1918 IV nadzwyczajny krug Syberyjskiego Wojska Kozackiego wybrał go na atamana Kozaków syberyjskich.
Jesienią 1918 wszedł do Tymczasowego Rządu Syberyjskiego kierowanego przez Piotra Wołogodskiego jako minister wojny, utrzymując równocześnie do listopada tego samego roku tytuł atamana Kozaków syberyjskich. 1 października 1918 r. mianowany dowódcą Armii Syberyjskiej Dyrektoriatu. W Omsku zajął na swoją rezydencję dawny pałac gubernatorski. W Armii Syberyjskiej wprowadził dawny regulamin armii Imperium Rosyjskiego, w tym prawo oficerów do wymierzania podkomendnym kar fizycznych. W momencie, gdy Tymczasowy Rząd Syberyjski rozwiązał się, uznając Ogólnorosyjski Rząd Tymczasowy (Dyrektoriat) powstały w Ufie, Iwanow-Rinow nominalnie zachował dowództwo Armii Syberyjskiej, jednak ministrem wojny w Dyrektoriacie ufijskim został adm. Aleksandr Kołczak. Iwanow-Rinow znajdował się wówczas we Władywostoku, gdzie reorganizował siły białych. 24 października 1918 r.