Матчі плей-офу Ліги чемпіонів КАФ 2016 проходили з 16 вересня по 23 жовтня 2016 року.
Формат Півфінал та фінал проводиться у форматі двох матчів: удома і на виїзді. Переможець визначається більшою кількістю голів за сумою двох матчів. Якщо сумарна кількість голів є рівною, застосовується правило виїзного гола. Якщо цей показник також рівний, то команди грають тридцять хвилин додаткового часу. Правило виїзного гола застосовується і під час додаткового часу. Якщо ж у додатковий час голів не було забито, переможець двобою визначається в серії пенальті.
Учасники Група Переможець Друге місце A Відад ЗЕСКО Юнайтед B Мамелоді Сандаунз Замалек
Календар РаундПерший матчМатч-відповідьПівфінал16–18 вересня 201623–25 вересня 2016Фінал14–16 жовтня 201621–23 жовтня 2016
Півфінал
У півфіналі переможець групи A грає проти команди, що зайнята друге місце в групі B; а переможець групи B проти команди, що зайнята друге місце в групі A. Учасники грають два матчі.
Замалек переміг із загальним рахунком 6–5.
Мамелоді Сандаунз переміг із загальним рахунком 3–2.
Фінал
У фіналі два півфіналіста грають два матчі один з одним.|}
Мамелоді Сандаунз переміг із загальним рахунком 3–1.
Примітки
Посилання Ліга чемпіонів КАФ 2016 на «CAFonline.com» Статистика Ліги чемпіонів КАФ 2016 на «worldfootball.com»