Тандемні повтори — послідовності повторюваних ділянок ДНК. Залежно від розміру, вони поділяються на три підкласи: сателіти, мінісателіти і мікросателіти. Назва «сателіти» походить від спектра оптичної густини при розділенні ДНК у градієнті густини розчинника, що вказує на відмінності відносного середнього вмісту різних нуклеотидів у тандемних повторах у порівнянні з рештою ДНК. Найбільша кількість повторів зустрічається у Eucalyptus grandis.
Сателіти
Розмір ділянок сателітів становить від 100 kbp до понад 1 Mpb, із повторюваною одиницею зазвичай >100 bp. У людини добре відомий приклад — альфоїдна ДНК, розташована в центромерах всіх хромосом. Довжина одного повтору становить 171 bp, а весь повторюваний регіон становить 3-5 % довжини ДНК кожної хромосоми. Інші сателіти мають коротшу довжину повтору. Більшість сателітів як людини, так і інших організмів, розташовані в центромері.
Мінісателіти
Розмір повної ділянки мінісателітів становить від 1 kb до 20 kb, із довжиною повтору зазвичай 7-100 bp. Один вид мінісателітів — «змінне число тандемних повторень» (). Його довжина повтору може бути від 9 до 80 пар основ, а повторювані ділянки розташовані в некодуючих регіонах геному. Число повторень для даного мінісателіту може відрізнятися між індивідуумами; ця особливість є основою методу генетичного фінґерпринтингу. Інший вид мінісателітів — теломери. У людських генеративних клітинах розмір теломер становить близько 15 kb. У старіючих соматичних клітинах, теломери можуть бути значно коротшими. У людини та інших ссавців теломери містять послідовність тандемних повторів GGGTTA.
Мікросателіти
Мікросателіти, також відомі як короткі тандемні повтори (), тому що розмір повтору складає лише від 1 до 6 bp, а повний розмір ділянки зазвичай становить до 150 bp. Подібно до мінісателітів, число повторень для даного мікросателіту може відрізнятися між індивідуумами. Тому мікросателіти також можуть бути використані для генетичного фінґерпринтингу.
Примітки
Посилання
Загальні тексти Molecular Biology Web Book: Tandem Repeats Приклади VNTRs — інформація та анімований приклад Бази даних The Microorganisms Tandem Repeats Database Short Tandem Repeats Database Tandem Repeats Database (TRDB) Системи пошуку Tandem Repeats Finder Mreps STAR TRED TandemSWAN Microsatellite repeats finder JSTRING — Java Search for Tandem Repeats in genomes Phobos — a tandem repeat search tool for perfect and imperfect repeats — the maximum pattern size depends only on computational power