Матчі групового етапу Ліги Європи УЄФА 2009—2010 проходили з 17 вересня по 17 грудня 2009 року. Жеребкування пройшло 28 серпня.
На даному етапі брали участь 48 команд: 38 команд, які перемогли в раунді стикових матчів та 10 команд, які програли в раунді стикових матчів Ліги чемпіонів 2009—10. Команди були поділені на 12 груп по 4 команди в кожній групі. Дві перші команди із кожної групи продовжили змагання.
Починаючи з цього етапу матчі обслуговувались п'ятьма польовими арбітрами: окрім говного та двох бокових рефері, були присутні два арбітри, що слідкували за штрафним майданчиком. Це нововведення є частиною експерименту, санкціонованого ФІФА.
Структура розподілу Розподіл команд по групах проводився за коефіцієнтами УЄФАContenders await group stage fate , UEFA.com.
Кошик 1Команда Коеф. Шахтар 74.370 Вердер 91.339 Вільяреал 80.853 Рома 78.582 ПСВ 75.826 Спортінг 68.292 Гамбург 67.339 Бенфіка 64.292 Валенсія 59.853 Панатінаїкос 56.633 Аякс 54.826 Стяуа 53.781Кошик 2Команда Коеф. Фенербахче 52.445 Базель 51.050 Лілль 47.033 Селтік 40.575 Евертон 35.899 Брюгге 34.065 Геренвен 33.826 Галатасарай 33.445 Андерлехт 32.065 Аустрія 31.565 Копенгаген 26.890 Лаціо 26.582Кошик 3Команда Коеф. Герта 26.339 Спарта 26.150 Динамо Бухарест 25.781 АЕК 25.633 Славія Прага 25.150 Левскі 24.250 Атлетик 23.853 Партизан 23.050 Хапоель Тель-Авів 18.050 Твенте 17.826 Динамо Загреб 16.466 Фулхем 15.899Кошик 4Команда Коеф. ЦСКА Софія 14.250 Тулуза 14.033 ЧФР Клуж 13.781 Дженоа 12.582 Рапід Відень 8.565 Тимішоара 7.781 БАТЕ 7.733 Насьонал 7.292 Ред Булл Зальцбург 6.565 Штурм 3.565 Вентспілс 2.832 Шериф 1.333
Критерії виходу при однаковій кількості очок На основі абзацу 4.05 правил УЄФА поточного сезону, якщо дві або більше команд здобудуть рівну кількість очок в змаганнях на груповій стадії, для визначення тих, хто просувається далі, будуть застосовані такі критерії: більша кількість очок, здобутих в матчах між цими командами; краща різниця м'ячів в матчах між цими командами; більша кількість м'ячів, забитих на виїзді в матчах між цими командами; краща різниця м'ячів в усіх матчах групової стадії; більша кількість м'ячів, забитих в усіх матчах; більший коефіцієнт клубу і його асоціації за останні п'ять сезонів.
Групи ЛегендаКоманди, що пройшли до плей-офКоманди, що вибули з подальшої боротьби в цьому сезоні
Час центральноєвропейський (UTC+1)
Група A
1 29 жовтня 2009 року Контрольно-дисциплінарна інстанція УЄФА покарала загребське Динамо за поведінку вболівальників під час матчу із Тимішоарою. Згідно з рішенням наступні два матчі клуб провів за закритими дверима і був позбавлений трьох очок в груповому етапі. Клуб подав апеляцію, яка була розглянута після матчу з Аяксом. Після розгляду було ухвалено рішення про умовну дискваліфікацію клубу в єврокубках на 3 роки, а також замінило зняття трьох очок грошовим покаранням в розмірі €75,000.
Група B
Група C
2 Рапід проводив домашні матчі на стадіоні Ернст-Гаппель-Штадіон.
Група D
3Вентспілс проводив домашні матчі групового етапу на стадіоні Сконто, Рига оскільки домашня арена не відповідала вимогам УЄФА.
Група E
4 ЦСКА Софія проводила домашні матчі групового етапу на стадіоні Васил Левський оскільки домашня арена Болгарська Армія не відповідала вимогам УЄФА.</div>
Група F
5 Панатінаїкос грав домашні матчі групового етапу на Олімпійському стадіоні в Афінах оскільки домашня арена Марфін буде відкрита тільки у 2010 році.</div> 6 Динамо Бухарест зіграга два домашні матчі без глядачів через поведінку своїх фанів під час матчу в раунді стикових матчів.</div>
Група G
Група H
7 Друга домашня гра яку Стяуа проведе без глядачів через поведінку своїх фанів під час матчу другого кваліфікаційного раунду з клубом Уйпешт.
Група I
8 БАТЕ проводив домашні матчі групового етапу на стадіоні Міський стадіон, Мінськ оскільки домашня арена не відповідала вимогам УЄФА.</div>
Група J
Група K
Група L
Примітки