Нерівнова́га за зче́пленням (також неврівнова́жене зче́плення ге́нів, англ. linkage disequilibrium, LD) — це невипадкова асоціація (поєднання) алелів різних локусів у популяції, за якої певні комбінації алелів у геномі зустрічаються частіше або рідше, ніж очікується за умови їхнього незалежного розподілу та успадкування.

Історія дослідження Теоретичне вивчення нерівноваги за зчепленням розпочав у 1918 році Р. Б. Роббінс (). Через десять років після того, як закон Гарді — Вайнберга заклав основи популяційної генетики для одного локусу, Роббінс розробив теорію для системи із двох локусів, яка враховувала концепції зчеплення та рекомбінації. Він уперше математично описав динаміку змін частот гаплотипів і довів, що за умови випадкового схрещування надлишок комбінацій алелів зменшується в кожному поколінні на величину, пропорційну частоті рекомбінації (r), і веде до поступового рівноважного стану популяції.

Популяційні чинники

У процесі мейозу гомологічні хромосоми кон'югують, що уможливлює обмін ділянками між несестринськими хроматидами — кросинговер, і ця мейотична рекомбінація створює нові комбінації алелів у гаметах, поступово знижуючи рівень нерівноваги за зчепленням у кожному наступному поколінні.

Природний добір діє у протилежному напрямку. Він може впливати на швидке поширення у популяції нейтральних варіантів, зчеплених з адаптивною мутацією, підвищуючи рівень нерівноваги за зчепленням.

Демографічні процеси, такі як різке скорочення чисельності, ефект засновника або міграційна ізоляція, формують загальногеномні патерни нерівноваги за зчепленням.

Аналіз локальних і загальногеномних профілів є інструментом дослідження історії розселення популяцій та закономірностей природного добору. Генетичне картування на основі нерівноваги за зчепленням аналізує рекомбінації, що накопичувалися впродовж багатьох поколінь в аутбредних популяціях неспоріднених особин. Використання великої кількості історичних рекомбінацій забезпечує високу роздільну здатність аналізу однонуклеотидних поліморфізмів (SNP).

Для візуалізації, розрахунку та інтерактивного аналізу патернів нерівноваги за зчепленням у біоінформатиці використовуються вебплатформи, такі як LDlink, що дають змогу вивчати зчеплення генетичних варіантів на основі даних масштабних популяційних досліджень.

Див. також Зчеплене успадкування Повногеномний пошук асоціацій

Примітки

Посилання LDlink — набір веб-додатків Національного інституту здоров'я (NIH) для аналізу нерівноваги за зчепленням у різних популяціях.