Sofia Magdalena kyrka kan syfta på:
Sverige Sofia Magdalena kyrka, Askersund – en kyrkobyggnad som tillhör Askersunds församling i Strängnäs stift Söderåkra kyrka – en kyrkobyggnad i Växjö stift, kallas även Sofia Magdalena kyrka Arjeplogs kyrka – en kyrkobyggnad i Arjeplog, kallas även Sofia Magdalena kyrka Algutsboda kyrka – en kyrkobyggnad i Algutsboda i Växjö stift, kallas även Sophia Magdalena kyrka Sofia Magdalena kyrka, Gävle – Hospitalskyrkan, förstörd i stadsbranden 1869
Finland Uleåborgs domkyrka – en nyklassicistisk kyrkobyggnad i Uleåborg Esse kyrka – en kyrkobyggnad i Esse Vihanti kyrka en kyrka i Vihanti, kallas även Sofia Magdalena Sofia Magdalena kyrka, Sastmola – gamla kyrkan i Sastmola kallades Sofia Magdalena