Ontologia genei (acr. en. GO) este o inițiativă bioinformatică majoră de a unifica reprezentarea genei și și a atributelor produsului genetic pentru toate speciile. Mai precis, proiectul urmărește: 1) menținerea și elaborarea vocabularului controlat al genelor și atributelor produsului genetic; 2) adnotarea genelor și produșilor genetici și asimilarea și diseminarea datelor de adnotare; și 3) furnizarea uneltelor pentru înlesnirea accesului la toate aspectele informațiilor furnizate de proiect și permiterea interpretării funcționale a datelor experimentale folosind GO.
GO face parte dintr-un efort mai mare de clasificare, Ontologiile Biomedicale Deschise (OBO, en.).
Deși nomenclatura genelor însăși urmărește să mențină și elaboreze vocabularul controlat al genelor și produșilor genetici, Ontologia genei extinde demersul utilizând un limbaj de marcare pentru a face datele (nu doar ale genelor și produșilor acestora dar și ale tuturor atributelor acestora) citibile de către mașină, într-un mod unificat pentru toate speciile (în timp ce convențiile din nomenclatura genelor diferă de la un taxon biologic la altul).
Exemplu de termen id: GO:0000016 nume: activitate lactază clasănume: funcție_moleculară def: „Cataliza reacției: lactoză + H2O=D-glucoză + D-galactoză.” [EC:3.2.1.108] sinonim: „activitate hidrolază a lactazei-lofrizinei” BROAD [EC:3.2.1.108] sinonim: „activitate galactohidrolază a lactozei” EXACT [EC:3.2.1.108] xref: EC:3.2.1.108 xref: MetaCic:LACTASE-RXN xref: Reactom:20536 este_o: GO:0004553 ! activitate hidrolază, hidroliza compușilor O-glicozil
Sursa datelor:
Consorțiu Consorțiul pentru Ontologia Genei este mulțimea de baze de date biologice și grupuri de cercetare implicate activ în proiectul ontologiei genei.
Note
Legături externe
Consorțiul pentru Ontologia Genei - situl oficial (en.) PlantRegMap - Adnotări GO pentru 165 de specii de plante și Analiza îmbogățirii GO (en.) SimCT (en.) — unealtă internet pentru afișarea relațiilor dintre obiecte biologice adnotate unei ontologii, în forma unui ansamblu arborescent. Ontologia genei pentru domenii (en.) — bază de date a ontologiilor de domeniu pe funcții, fenotipuri, boli și altele.
Categorie:Ontologie (informatică) Categorie:Bioinformatică