第16飛行団（だいじゅうろくひこうだん）は、日本陸軍の飛行団の一つ。

沿革 1944年（昭和19年）4月に第51戦隊、第52戦隊（共に四式戦闘機装備）を指揮下に置き設立される。

1944年（昭和19年）9月留守教育隊を残置しフィリピン戦線に転戦。第30戦闘飛行集団隷下。

1944年（昭和19年）11月末隷下51,52戦隊長の戦死など戦力を消耗し戦力回復のため防府に帰還。直後に下館に移駐。

飛行団概要 使用機種：四式戦闘機・ 歴代飛行団長 新藤常右衛門　中佐（陸士36期）：1944年4月3日 - 山田邦雄 少佐：1945年2月1日 -

所属部隊（設立時） 飛行第51戦隊（四式戦）：中島凡夫 少佐 飛行第52戦隊（四式戦）：沢山義隆 大尉

参考文献 『光人社NF文庫　あゝ疾風戦闘隊　大空に生きた強者の半生記録』（光人社、2004年） ISBN 4-7698-2108-5　c0195 外山操・森松俊夫編著『帝国陸軍編制総覧』芙蓉書房出版、1987年。