ニンテンドーDSのゲームタイトル一覧 (2006年)（ニンテンドーディーエスのゲームタイトルいちらん (2006ねん)）では、ニンテンドーDS対応として、2006年に発売されたゲームソフト全239タイトルを発売順に列記する。
発売ソフトの形態・変遷 メディアクリエイトによる『2007テレビゲーム産業白書』によると、2006年はハード・ソフトともにニンテンドーDSの人気はヒートアップする一方だったという 。ソフトの総売り上げは年間約3700万本を超えており、100万本を売り上げた作品も2005年の2作品から8作品に増えた。『2007テレビゲーム産業白書』が分類したジャンル別販売本数の構成比によると、その他が4割以上を占めており、次いで『ポケットモンスター』シリーズをはじめとするRPGが2割強、その次にはアクションゲームが2割弱を占めていた。中でも『New スーパーマリオブラザーズ』（2006年5月25日発売）は300万本を超える売り上げをみせ、アクションゲームをけん引した。同作は3DCGを採用しつつも、2Dアクションゲームや単純な操作体系といったわかりやすさが幅広いユーザに支持され、歴代のニンテンドーDS用ソフトの中で最も売れた作品となった。
8月24日に発売された『ルーンファクトリー -新牧場物語-』は『牧場物語』にアクションRPGの要素を組み込んだ作品であり、もともとは牧場物語シリーズ10周年記念作品という位置づけだったが、2年後の2008年に発売された『ルーンファクトリー2』以降は独立したシリーズとして扱われるようになった。
カジュアル分野においては、「料理がテーマのおままごと遊び」をコンセプトとした『クッキングママ』が料理に興味を持ってもらう仕組みづくりを優先した結果、日本国内だけでも7万本の売れ行きを記録した。また、同作の北米版がE3 2006でプレイアブル出展された際にアメリカのゲーム専門誌「IGN」の「Best DS Most Innovative Design」アワードを受賞したことで、欧米での大ヒットにつながり、日本国外で和食の人気が上がり始めたことも拍車をかけた。その後同作はシリーズ化し、日本国外のユーザーからの要望も取り入れながら発展していった。
なお、2006年5月には、コンピュータエンターテインメントレーティング機構（以下：CERO）のレーティングが改正され、従来の「18歳以上対象」が「D:17歳以上対象」と「Z:18歳以上のみ対象」の2つに分けられた。このうち、改正前（2006年1月19日）に発売された『バイオハザード デッドリーサイレンス』は、「18歳以上対象」から「D:17歳以上対象」に変更された旧CEROレーティングマーク「18才以上対象区分」のゲームソフトについて - カプコン公式ホームページより、2023年4月9日閲覧。。
2006年