Eugene Merle Shoemaker (28. huhtikuuta 1928 Los Angeles, Kalifornia, Yhdysvallat – 18. heinäkuuta 1997) oli yhdysvaltalainen tähtitieteilijä. Hän on planeettatutkimuksen uranuurtajia. Shoemaker on Shoemaker-Levy 9 -komeetan löytäjä yhdessä vaimonsa Carolyn Shoemakerin ja kollegansa David Levyn kanssa.
Shoemaker halusi aikanaan päästä astronautiksi Apollo-ohjelmaan mutta terveyssyistä ei onnistunut. Myöhemmin hän muun muassa etsi meteoriittikraattereita maapallolta. Eräällä tällaisella matkalla Australiassa hän kuoli auto-onnettomuudessa. Hänen ruumiinsa tuhkattiin ja osa siitä laitettiin pieneen koteloon avaruusluotain Lunar Prospectorin sisään. Kun luotain iskeytyi Kuuhun, Shoemakerin tuhkat levisivät Kuun etelänavalle. Hän on toistaiseksi ainoa henkilö, joka on haudattu Kuuhun.
Asteroidi 2074 Shoemaker on nimetty hänen kunniakseen.
thumb|left|upright|Eugene Shoemaker yllään rakettivyö.
Lähteet
Luokka:Yhdysvaltalaiset tähtitieteilijät Luokka:Liikenneonnettomuudessa kuolleet Luokka:Vuonna 1928 syntyneet Luokka:Vuonna 1997 kuolleet