Mikrobiekologia on mikrobien toimintaa ekosysteemissä tutkiva tieteenala. Maaperän mikrobit toimivat eloperäisen aineksen hajottajina. Ne ovat itse sukkulamatojen ravintoa. Peltojen mikrobien toiminta edellyttää sopivia olosuhteita, joita ovat sopiva kosteus, maaperän kuohkeus ja sopiva pH. Tämän vuoksi pellot tulee kuivattaa runsaiden sateiden jälkeen ja peltomaan riittävästä kalkituksesta tulee huolehtia. Myös peltomaan liikaa tiivistämistä ja torjunta-aineiden käyttöä tulee välttää. Myös viljelykierrolla parannetaan peltomaan mikrobien toimintaa.
Jotkut mikrobit toimivat symbioosissa palkokasvien ja sienirihmastojen kanssa. Sienten ja mikrobien symbioosissa ravinteet tulevat hajotettua tehokkaasti, jolloin ne ovat helposti kasvien otettavissa. Mikrobit toimivat hajottajina myös kompostissa. Talvella jotkut mikrobit, kuten lumihomeet muodostavat kasvustoja, jotka paljastuvat lumen sulettua. Kasvien juuristoon kertyy talvella mikrobeja, jotka suojaavat kasvia kuivumasta kylmänä aikana.
Jotkut mikrobit ovat erikoistuneempia tiettyihin orgaanisiin aineisiin kuin toiset. Vesistöissä mikrobeja esiintyy enemmän hapakkaissa oloissa kuin vähähappisissa oloissa. Jotkut vesi- ja kosteikkokasvit hapettavat kasvualustaansa. Näin mikrobien määrä vesistöissä ja kosteikkoalueilla riippuu kasviston koostumuksesta ja määrästä.
Lähteet
Luokka:Ekologia