SET (supresor šarolikosti, tritoraksni izmjenjivač Zeste) i MYND (mijeloid-Nervni-DEAF-1) protein 3 sa domenom jest protein/enzim koji je kod ljudi kodiran genom SMYD3 sa hromosoma 1.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 428 aminokiselina, a molekulska težina 49.097 Da.
1020304050 MEPLKVEKFATAKRGNGLRAVTPLRPGELLFRSDPLAYTVCKGSRGVVCD RCLLGKEKLMRCSQCRVAKYCSAKCQKKAWPDHKRECKCLKSCKPRYPPD SVRLLGRVVFKLMDGAPSESEKLYSFYDLESNINKLTEDKKEGLRQLVMT FQHFMREEIQDASQLPPAFDLFEAFAKVICNSFTICNAEMQEVGVGLYPS ISLLNHSCDPNCSIVFNGPHLLLRAVRDIEVGEELTICYLDMLMTSEERR KQLRDQYCFECDCFRCQTQDKDADMLTGDEQVWKEVQESLKKIEELKAHW KWEQVLAMCQAIISSNSERLPDINIYQLKVLDCAMDACINLGLLEEALFY GTRTMEPYRIFFPGSHPVRGVQVMKVGKLQLHQGMFPQAMKNLRLAFDIM RVTHGREHSLIEDLILLLEECDANIRAS
Funkcija
SMYD3 je lizinska metiltransferaza koja specifično metilira H3K4 i H4K5. SMYD3 igra ulogu u regulaciji transkripcije kao član kompleksa RNA polimeraze. Također je uključen u regulaciju raka.
Ekspresija SMYD3 je pretežno eksprimiran u skeletnim mišićima i sjemenicima.
Modelni organizmi
+ Fenotip Smyd3 nokaut-miševa Svojstvo Fenotip Vijabilnost homozigota Normalan Tjelesna težinaNormalan Anksioznost otvorenog poljaNormalan Neurololožka procjena Normalan Snaga stiskaNormalan Test vruće ploče Normalan Dismorfologija Normalan Indirektna kalorimetrija Normalan Test tolerancije glukoze Normalan Slušni odgovor moždanog stabla Normalan DEXA Normalan Radiografija Normalan Tjelesna temperaturaNormalan Morfologija okaNormalan Klinička hemija Normalan Plazmatski imunoglobulini Normalan Hematologija Normalan Limfociti periferne krvi Normalan Mikronukleus test Normalan Težina srca Normalan Histopatologija mozga Normalan Salmonella infekcija Normalan Citrobacter infekcija Normalanvi testovi raspoloživi premaMouse Resources Portal, Wellcome Trust Sanger Institute. U proučavanju funkcije SMYD3 korišteni su modelni organizmi. Uslovna linija nokaut-miša, zvana Smyd3tm2a(KOMP)Wtsi generirana je u programu Međunarosnog konzorcija za nokaut-miševe – visokopropusnom Projektu mutageneze za generiranje i distribuciju životinjskih modela bolesti zainteresiranim naučnicima — na Institutu Wellcome Trust Sanger.
Mužjaci i ženke su podvrgnute standardiziranom fenotipskom pregledu, kako bi se utvrdili efekti delecija. Obavljena su 23 testa na homozigotnim mutantnim odraslim miševima, ali nisu uočene značajne abnormalnosti.
Interakcije
Pokazalo se da SMYD3 ima interakcijw sa članom A1 alfa citosolnog proteina toplotnog šoka od 90kDa i POLR2A.
SMYD3 trimetilira lizinske ostatke na MAP3K2, što uzrokuje unakrsni kontakt u signalnom putu MAP-kinaza Ras-izazvanim kancerima.
Klinički značaj SMYD3 igra važnu ulogu u napredovanju karcinoma kod ljudi. Visoko je eksprimiran kod brojnih karcinoma, kao što su karcinomi jetre, rak dojke i kolorektumski karcinom. Poznato je da SMYD3 ima ulogu i kod karcinoma pluća, jednjaka i prostate.
Primijećeno je da kod karcinoma pluća i debelog crijeva, metilacija MAP3K2 pomoću SMYD3 poboljšava inhibitornu kontrolu PPA2, što dovodi do nadjačavanja signala apoptoze, putem aktivacije MEK/ERK signalizacijske kaskade. Kod karcinoma debelog crijeva i jetre, metilacija H3 posredovana putem SMYD3 pospješuje regrutaciju RNAP II i pridruženih faktora transkripcije iz protoonkogenih regija.
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni na hromosomu 1 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika Kategorija:Mišji mutirani geni