Mitohondrijska intermedijarna peptidaza je enzim koji je kod ljudi kodiran genom MIPEP.
Ovaj protein je kritična komponenta mehanizma za import ljudskih mitohondrijskih proteina uključenih u proces sazrijevanja jedarno kodiranih mitohondrijskih proteina, s mitohondrijskim translokacijskim peptidima, posebno onih proteina povezanih s OXPHOS-om.
Struktura
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 713 aminokiselina, a molekulska težina 80.641 Da
1020304050 MLCVGRLGGLGARAAALPPRRAGRGSLEAGIRARRVSTSWSPVGAAFNVK PQGSRLDLFGERRGLFGVPELSAPEGFHIAQEKALRKTELLVDRACSTPP GPQTVLIFDELSDSLCRVADLADFVKIAHPEPAFREAAEEACRSIGTMVE KLNTNVDLYQSLQKLLADKKLVDSLDPETRRVAELFMFDFEISGIHLDKE KRKRAVDLNVKILDLSSTFLMGTNFPNKIEKHLLPEHIRRNFTSAGDHII IDGLHAESPDDLVREAAYKIFLYPNAGQLKCLEELLSSRDLLAKLVGYST FSHRALQGTIAKNPETVMQFLEKLSDKLSERTLKDFEMIRGMKMKLNPQN SEVMPWDPPYYSGVIRAERYNIEPSLYCPFFSLGACMEGLNILLNRLLGI SLYAEQPAKGEVWSEDVRKLAVVHESEGLLGYIYCDFFQRADKPHQDCHF TIRGGRLKEDGDYQLPVVVLMLNLPRSSRSSPTLLTPSMMENLFHEMGHA MHSMLGRTRYQHVTGTRCPTDFAEVPSILMEYFANDYRVVNQFARHYQTG QPLPKNMVSRLCESKKVCAAADMQLQVFYATLDQIYHGKHPLRNSTTDIL KETQEKFYGLPYVPNTAWQLRFSHLVGYGARYYSYLMSRAVASMVWKECF LQDPFNRAAGERYRREMLAHGGGREPMLMVEGMLQKCPSVDDFVSALVSD LDLDFETFLMDSE Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Gen
Gen MIPEP kodira jednu metaloproteazu koja hidrolizira peptidni fragment od osam aminokiselina u dužini za obradu proteina usmjerenih na mitohondrije. Ljudski gen MIPEP ima 21 egzon i nalazi se na hromozomskoj sekvenci 13q12. Pokazano je da je ljudski gen MIPEP visoko eksprimiran u srcu, skeletnim mišićima i gušterači, tri organska sistema koji se često prijavljuju sa poremećajima OXPHOS-a.
Protein
Ljudski protein mitohondrijska intermedijarna peptidaza, veličine je 80,6 kDa i sastoji se od 713 aminokiselina. Sadrži mitonhondrije koje ciljaju peptid (aminokiselina 1-35 peptidne sekvence). Zreli protein ima teorijski pI 6,03.
Funkcija
Djelujući zajedno s općom mitohondrijskom procesnom peptidazom (MPP), MIPEP ima ključnu ulogu u sazrijevanju određene klase jedarno kodiranih proteinskih prekursora, koje karakterizira motiv, XRX (f) (F/L/I) XX (T/S /G) XXXX (f). U početku, peptidaza MPP cijepa prekursore na pozicijama dvije peptidne veze iz R-ostatka, ostavljajući tipski oktapeptid na N-kraju proteina; nakon toga, MIP cijepa oktapeptid, dovršavajući konačno sazrijevanje prerađenog proteina. Nedavno istraživanje pokazalo je da mitohondrijska intermedijarna peptidaza može razgraditi transmembranski receptor Notch na svom mjestu S5 i pomoći sazrijevanju notch proteina.
Klinički značaj
U GWAS (eng. Genome-Wide Association Study) studiji kineske populacije, zabilježena je značajna povezanost između visoke miopije i varijante na sekvenci q12.12 hromosoma 13. Geni MIPEP i C1QTNF9B nalaze se u istom lokusu i izgledaju eksprimirani u mrežnjači i njenom pigmentnom epitelu (RPE) i stoga su vjerojatno povezani s visokom kratkovidnošću. Međutim, funkcionalni dokazi koji povezuju MIPEP s kratkovidnošću tek trebaju biti pruženi.
Bialelne patogene varijante u MIPEP-u prisutne su u ranom dojenačkom uzrastu ili ranom djetinjstvu s hipotonijom (niskim mišićnim tonusom) i rijetkim tipom kardiomiopatije, koja se naziva nekompakcija lijeve komore. Mogu se vidjeti i katarakti. Kod četiri prijavljena pacijenta do sada je kardiomiopatija progresivna i rezultira smrću u prvih nekoliko godina života.
Reference
Kategorija:Mitohondrijski proteini Kategorija:Geni na hromosomu 13 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika