W Korczy Frashëri wystąpił na wiecu, proklamując przyłączenie Autonomicznej Albańskiej Republiki Korczy do nowego państwa albańskiego.
W latach 1921–1934 związany politycznie z Ahmedem Zogu i kierowaną przez niego Partią Ludową (Partia e Popullit). W 1922 opracował pierwszy plan zagospodarowania przestrzennego Tirany. W październiku 1923 przewodniczył delegacji albańskiej, która udała się do Ankary w celu nawiązania stosunków dyplomatycznych z Republiką Turcji.
W latach 1922–1924 pełnił funkcję przewodniczącego parlamentu. W 1925 uzyskał mandat senatora i we wrześniu objął funkcję przewodniczącego senatu. W tym samym czasie ujawniono spisek przeciwko prezydentowi Zogu, kierowany przez jego szwagra Ceno bega Kryeziu. Frashëri był powiązany ze spiskowcami i po jego ujawnieniu podał się do dymisji, a następnie wyjechał na Korfu. W 1932 powrócił do kraju i ponownie został wybrany do parlamentu. W lutym 1938 zasiadał w radzie nadzorczej włosko-albańskiego przedsiębiorstwa eletrycznego SITA. Zmarł nagle w Tiranie.