Wyjątkiem była sytuacja z 2018, gdy organizator europejskich pucharów, European Professional Club Rugby, podjął decyzję o niedopuszczeniu do udziału w Challenge Cup zwycięzcy jednego z play-off, niemieckiej drużyny . Było to spowodowane faktem, że w rozgrywkach występuje inny klub należący do tego samego właściciela, co mogłoby mieć wpływ na wyniki. W to miejsce zakwalifikowano pokonaną przez zespół z Heidelbergu w play-off rumuńską drużynę .
W sezonach 2016/2017 i 2017/2018 rozgrywany był ponadto finał Continental Shield, w którym uczestniczyły dwie drużyny, które w danym sezonie zdobyły awans do Challenge Cup. Miał on miejsce w tym samym dniu i w tej samej miejscowości, co finał European Rugby Challenge Cup. W sezonie 2018/2019 nie zaplanowano rozegrania takiego finału.
Uczestnicy rozgrywek W pierwszej edycji rozgrywek wzięły udział drużyny z Włoch, Rumunii i Gruzji. W kolejnym roku dołączyły ekipy z Hiszpanii, Rosji i Portugalii, a w sezonie 2015/2016 – także z Belgii i Niemiec.