Służba 10 listopada 1917 roku (w dniu przyjęcia okrętu do służby) dowódcą jednostki został mianowany kapitan marynarki () Hans Trenk. 10 lutego 1918 roku jednostka została przydzielona do służby w V Flotylli. Pierwszą zatopioną przez UB-86 jednostką był pływający dla szwedzkiego armatora statek parowy Mercia, który został storpedowany 85 mil na wschód od Peterhead. Zbudowany w 1882 roku w Irvine & Co. statek płynął z ładunkiem desek z Halmstad do Hull. 21 lutego 1918 roku statek został storpedowany. W wyniku ataku śmierć poniosło 18 członków załogi. W czasie kolejnego patrolu okręt operował na zachód od Szkocji i na północ od Irlandii. 11 kwietnia 1918 roku 30 mil na północ od Malin Head UB-86 storpedował i uszkodził zbudowany w 1901 roku w Vickers, Sons & Maxim, Ltd. krążownik pancerny HMS „King Alfred”. Tydzień później u północnych wybrzeży Kornwalii UB-86 zaatakował i zatopił brytyjski statek parowy z 1899 roku Gregynog (1714 BRT). Od 5 maja 1918 roku okręt został przydzielony do III Flotylli. 17 sierpnia na północny zachód od St Ives w Konrwalii, UB-86 zatopił dwa statki. Pierwszym był pochodzący z 1899 roku brytyjski parowiec Denebola (1481 BRT). Statek płynął ze Swansea do Rouen z ładunkiem węgla. W wyniku ataku statek zatonął na pozycji . Zginęło 2 członków załogi.