Artura Malawskiego w Krakowie, za Kroniki mazurskie 1982 – nagroda Prezesa Rady Ministrów za twórczość dla dzieci i młodzieży 2001 – wyróżnienie Międzynarodowej Trybuny Kompozytorów UNESCO za Muzyczkę na koniec wieku 2015 – Srebrny Medal „Zasłużony Kulturze Gloria Artis” 2015 – Doroczna Nagroda Związku Kompozytorów Polskich
Honorowe obywatelstwa 1965 – miasta Ruse (Bułgaria) 1966 – miasta Kragujevac (Jugosławia) 1980 – miasta Ho Chi Minh (Wietnam)
Twórczość Muzyka Penherskiego wyrasta z doświadczeń europejskiej awangardy postserialnej i sonoryzmu lat 60. Jedną z jego pryncypialnych zasad jest nadrzędność formy wyrażana poprzez zagęszczanie brzmienia, progresje quasi-melodyczne, diminucje rytmiczne itp., które w połączeniu z sonorystycznym materiałem pozwalają osiągnąć pożądany efekt dramaturgiczny. Bardzo ważnym elementem techniki dźwiękowej Penherskiego jest rytm, polirytmia i politemporalność, wymagające niejednokrotnie wprowadzenia do utworu metronomów, jak w Kwartecie instrumentalnym lub w utworze String Play.