Lenina, ale z nazwy tej szybko zrezygnowano, gdyż odstraszała zagranicznych kontrahentów i powrócono do nazwy Škoda.
Po 1989 rozpoczęto prywatyzację, a w 1992 podjęto decyzję o wyborze tzw. „czeskiej drogi” podczas prywatyzacji (prywatyzacja bez udziału spółek zagranicznych). Spowodowało to problemy finansowe, ale groźbę bankructwa zażegnano w roku 1999 poprzez umowę z bankami. W kwietniu 2000 założono spółkę akcyjną Škoda Holding.
Od jesieni 2017 roku Škoda Transportation jest własnością grupy kapitałowej PPF. W maju 2018 r. zakończył się trwający od 2015 proces wykupu 100% akcji fińskiego producenta taboru Transtech.
Oddziały Škoda Holding Energetyka: Škoda Power a.s. Škoda Power Pvt. Ltd. Škoda Jinma Turbine Ltd. Transport: Škoda Transportation a.s. Škoda Electric s.r.o. Škoda Vagonka, a.s Sibelektroprivod Škoda Ostrov s.r.o. VÚKV, a.s.
Produkcja środki transportu (lokomotywy, tramwaje, trolejbusy) obrabiarki energetyka badania i rozwój
Tramwaje thumb|Tramwaj Škoda 14 T dla Pragi Škoda wykorzystała lukę po największym producencie taboru tramwajowego w Czechach – zakładach ČKD w Pradze, które zostały wykupione przez koncern Siemens i zaprzestały produkcji tramwajów.