Organy Kościół od początku swego istnienia posiadał organy piszczałkowe. Pierwszymi z nich był instrument Jana Śliwińskiego ze Lwowa. Według relacji ustnych organy lwowskiego budowniczego zostały poważnie uszkodzone w czasie II wojny światowej. Dalszego zniszczenia dokonały drewnojady, przez co instrument w tym stanie nie nadawał się już do remontu, w związku z czym postanowiono wybudować nowy, który funkcjonuje do dziś. Obecne organy są dziełem firmy Włodzimierza Truszczyńskiego z Warszawy, a ich budowę ukończono w 1963 r. Brzmienie instrumentu było prezentowane m.in. podczas Festiwalu Muzyki Sakralnej czy Jesiennego Festiwalu Muzycznego Alkagran.
Dyspozycja instrumentu: Manuał IManuał IIPedał1. Vox Coelestis 8'1. Pryncypał fletowy 8'1. Kontrabas 16'2. Trompet 8'2. Bourdon 8'2. Subbas 16'3. Pryncypał 8'3. Aeolina 8'3. Pryncypałbas 8'4. Holflet 8'4. Prestant 4'4. Fletbas 8'5. Salicet 8'5. Rurflet 4'5. Chorałbas 4'6. Oktawa 4'6. Nasard 2 2/3'6. Fagot 16'7. Flet kryty 4'7. Pikolo 2'8. Super oktawa 2'8. Tercja 1 3/5'9. Mikstura 3 ch.9. Cymbel 3 ch.10. Kornet 4 ch.10. Obój 8'