Pokrajac miał się zmierzyć z Thiago Silvą 15 maja 2012 r. Na UFC w Fuel TV: Korean Zombie vs. Poirier, zastępując kontuzjowanego Brandona Vera. Jednak Silva został wycofany z walki, aby zmierzyć się z Alexandrem Gustafssonem 14 kwietnia 2012 roku na UFC na Fuel TV 2 po tym, jak oryginalny przeciwnik Gustafssona Antônio Rogério Nogueira wycofał się z walki, powołując się na kontuzję. Pokrajac zamiast tego zmierzył się z Fábio Maldonado podczas tego wydarzenia. Wygrał walkę jednomyślną decyzją (29–28, 30–27 i 29–28).
Pokrajac został pokonany przez Vinny'ego Magalhãesa przez drugi okrągły pałąk 22 września 2012 roku na UFC 152.
Pokrajac następnie zmierzył się z Joeyem Beltranem 15 grudnia 2012 roku na UFC na FX 6, zastępując kontuzjowanego Anthony'ego Perosha. Pokrajac przegrał walkę jednogłośnie. Jednak 10 stycznia 2013 r. Ogłoszono, że Beltran nie przeszedł testu narkotykowego po walce, testując pozytywnie na nandrolon, a wynik walki został zmieniony na Brak konkursu.
Pokrajac zmierzył się z Ryanem Jimmo na UFC 161 w Winnipeg, Manitoba 15 czerwca 2013 r. Przegrał walkę jednogłośnie.
Pokrajac zmierzył się z Rafaelem Cavalcante 9 listopada 2013 r. Na UFC Fight Night 32. Przegrał przez poddanie z powodu strajków w pierwszej rundzie.