W 1899 roku przy kościele byli wybudowane Dom Parafialny oraz Szkoła Parafialna. W 1915 r. Parafia w Permie liczyła koło 1500 osób, większość to była Polacy, ale byli też Litwini, Węgrzy, Białorusini, Ukraińcy, Niemcy, Francuzi. W kwietniu 1918 roku powstał Dekanat Permski, do którego należały parafie katolickie Permu, Wiatki, Jekaterynburgu i Czelabińsku.
Po rewolucji 1917 r. władza radziecka nacjonalizowała budynki przykościelne, ale sam kościół jeszcze nie, i w 1926 r. parafia liczyła koło 500 katolików. 20 lutego 1936 r. kościół został zamknięty, ksiądz proboszcz Parafii Franciszek Budrys oraz najbardziej aktywni parafianie zostali rozstrzelani. W budynku kościoła powstał klub głuchoniemych.
Odbudowa działalności Kościoła Katolickiego w Rosji rozpoczęła się na początku lat 1990. XX wieku. W 1991 r. po wielu latach nieobecności odnawia się Parafia rzymskokatolicka Niepokalanego Poczęcia Najświętszej Maryi Panny w Permie, w 1993 r. Parafię obejmuje nowy ks. proboszcz Andrzej Grzybowski, w 1994 roku budynek kościoła był oddany Parafii. Budynek potrzebował gruntownych prac remontowych oraz konserwatorskich, które trwali przez cztery lata. 9 sierpnia 1998 r. arcybiskup Tadeusz Kondrusiewicz drugi raz poświęcił budynek kościoła. Teraz ks.