Równocześnie na Wydziale Nauk Medycznych Polskiej Akademii Nauk (PAN) utworzono Komisję Transplantologii, której przez cztery kadencje przewodniczył Kazimierz Ostrowski. Następnie otrzymał nominację na zastępcę sekretarza Wydziału Nauk Medycznych PAN, dzięki czemu zasiadał w Kolegium Doradczym Przewodniczącego Wydziału. W 1970 Kazimierz Ostrowski stanął na czele utworzonego Instytutu Biostruktury i kierował nim do 1992, od 1990 jest to Centrum Biostruktury WUM. W 1988 stanął na czele powstałego przy Ministerstwie Zdrowia i Opieki Społecznej Zespołu ds. Pobierania i Przeszczepiania Tkanek i Narządów, którego głównym zadaniem była koordynacja i informowanie ministerstwa o postępach i potrzebach w zakresie transplantologii, w 1994 został przekształcony w Krajową Radę Transplantacyjną. W 1992 prof. Kazimierz Ostrowski przeszedł na emeryturę, pozostając czynnym naukowo uzyskał grant na prowadzenie badań nad genetyczną regulacją ekspresji białek morfogenetycznych tkanki kostnej, badania te prowadził do końca życia.
Zmarł 9 stycznia 2010, został pochowany na cmentarzu Wolskim w Warszawie.
Dorobek naukowy Publikacje 300 prac naukowych. 8 podręczników.
Opieka naukowa Wypromował 31 doktorów nauk medycznych lub przyrodniczych. 17 naukowców uzyskało pod jego kierunkiem habilitację.